Pada 1831, Kapodistrias mengarahkan pemenjaraan Petrobey Mavromichalis dan seorang abangnya, Tzanis atas kesalahan ingkar ke atas gabenor Lakonia. one of the wildest and most rebellious parts of Greece—the only section that had retained its independence from the Ottoman Empire and whose resistance had spearheaded the successful revolution.[25] Penahanan adik-beradik ini dianggap mencalar maruah keluargga Mavromichalis, maka seorang adiknya Konstantinos dan anaknya Giorgios bersumpah membalas dendam.

Ioannis keluar pada pagi hari 27 September 1831 untuk bersembahyang di gereja Santo Spyridon di Nafplion pada 27 September 1831 meskipun ditegah berbuat demikian oleh para pembantunya.[26] Saat beliau tiba di pintu gereja, Konstantinos dan Giorgios anak-beranak mengecamnya. Ioannis cuba menyapa mereka, namun Konstantinos menembak sedas peluru yang tersasar. Giorgios mengambil kesempatan ini menikam dada Ioannis sambil Konstantis menembak mati Ioannis di kepalanya.

Konstantinos segera mati ditembak dalam serangan balas dari belakang oleh seorang pegawai tentera bernama Fotomaras yang menyaksikan kejadian dahsyat dari tingkap rumahnya.[27] Mayat Konstantis mula dibawa beramai-ramai warga Nafplion ke suatu tebing tinggi untuk dihumbankan jauh.